42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5240 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  60.19 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  59.18 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  53.4 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  52.43 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  50.51 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  52.43 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  46.88 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  54.74 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  51.52 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  50.51 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  50 
 
 		 1294 aa  94.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  45.92 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  37.37 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  40.4 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  51.02 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  35.92 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  31.31 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  30.19 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  30.38 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  31.91 
 
 		 118 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  24.72 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  41.51 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1466  hypothetical protein  40.68 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>