48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1674 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  46.32 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  50 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  46.81 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  45.83 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  45.92 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  44.79 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  42.71 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  42.42 
 
 		 1294 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  51.61 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  39.22 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 108 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  42.27 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  40.66 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  43.01 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  45.98 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  38.04 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.17 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  30.53 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  35.11 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  42.31 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  52.94 
 
 		 280 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  38.27 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  56.41 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  27.18 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  35.85 
 
 		 281 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  34.52 
 
 		 144 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.11 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  51.28 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  25.81 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  32.73 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  42.19 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  34.85 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>