16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2811 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
289 aa  595  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  86.16 
 
 
289 aa  523  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  52.04 
 
 
281 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  40.56 
 
 
273 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  36.9 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 
274 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  35.27 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  30.71 
 
 
256 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  29.67 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  25.22 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  29.28 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2758  hypothetical protein  80.49 
 
 
42 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1978  hypothetical protein  21.63 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  25.56 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  32.39 
 
 
105 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>