17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7419 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  55.6 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  53.16 
 
 		 274 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  42.69 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  42.91 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  35.71 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  31.54 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  39.82 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  37.66 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  39.22 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  35.32 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1978  hypothetical protein  29.88 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1506  hypothetical protein  25.93 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  52.94 
 
 		 105 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2758  hypothetical protein  47.62 
 
 		 42 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>