20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1754 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  45.66 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  41.15 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  42.57 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  42.69 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  40.56 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  42.5 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  33.04 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  32.87 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1978  hypothetical protein  28.45 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  29.78 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  36.2 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  33.92 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1506  hypothetical protein  25.62 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  38.24 
 
 		 108 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 105 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2758  hypothetical protein  48.78 
 
 		 42 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000095  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  25.6 
 
 		 774 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.940943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  39.06 
 
 		 103 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>