17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1402 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 275 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  60.29 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  56.76 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  42.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  37.19 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  35.69 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  36.52 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  40.3 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  38.05 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  36.36 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  37.93 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  37.44 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  32.59 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1978  hypothetical protein  28.85 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1506  hypothetical protein  23.84 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  53.49 
 
 		 155 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  30.71 
 
 		 1097 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>