15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3751 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  57.55 
 
 
255 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  66.53 
 
 
257 aa  263  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  61.69 
 
 
281 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  46.38 
 
 
256 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  35.93 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  37.13 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  33.48 
 
 
281 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  32.75 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  27.59 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  26.25 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  23.94 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  32.37 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 
131 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  30.91 
 
 
146 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>