15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3528 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 257 aa  510  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  64.26 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  69.39 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  65.7 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  48.51 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  38.17 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  39.09 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  37.42 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  27.88 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  30.09 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 289 aa  85.9  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  31.65 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2758  hypothetical protein  50 
 
 		 42 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  41.35 
 
 		 114 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>