15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1987 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 274 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  60.29 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  53.16 
 
 		 280 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  40.3 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  39.2 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  34.66 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  39.22 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  41.26 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  35 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  37.79 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  33.7 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  36.02 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1978  hypothetical protein  29.22 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  38.82 
 
 		 110 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>