38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  54.64 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  56.7 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  56.7 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  48.98 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  54.74 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  53.12 
 
 		 1294 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  46.94 
 
 		 108 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  47.96 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  45.92 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  41.84 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  56.25 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  41.84 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  35.35 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 95 aa  66.6  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  34.74 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  25.26 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  28.74 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  40.74 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  29.67 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  29.67 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  39.06 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  45 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  32.65 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>