35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1656 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 103 aa  205  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  60 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  56.25 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  56.44 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  49 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  49.49 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  51.61 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  51.02 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  49.5 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  50.5 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  49.5 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  46.39 
 
 		 1294 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  48.51 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  41.84 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  41.76 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  37.25 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  35.42 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  34.69 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  29 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1466  hypothetical protein  44.9 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  26.53 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  26.97 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>