46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1560 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 105 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  35.58 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  41.76 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  26.04 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  31.31 
 
 		 1294 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  26.8 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  31.96 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  32.99 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  26.8 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  27.71 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  29.89 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  36.62 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  46.51 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  29.29 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  37.1 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  29.27 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  32.35 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  29.49 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 106 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.47 
 
 		 135 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>