More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000095 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  47.64 
 
 
759 aa  764    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.64 
 
 
759 aa  764    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12914  formate dehydrogenase H fdhF  52.54 
 
 
779 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.812577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.71 
 
 
763 aa  774    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  54.62 
 
 
788 aa  878    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  71.88 
 
 
781 aa  1177    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  76.49 
 
 
776 aa  1270    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  47.51 
 
 
759 aa  762    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  71.22 
 
 
781 aa  1172    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  57.44 
 
 
764 aa  875    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  56.81 
 
 
779 aa  885    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.61 
 
 
772 aa  700    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  76.13 
 
 
775 aa  1270    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  55.76 
 
 
769 aa  893    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2382  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.2 
 
 
763 aa  789    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  56.42 
 
 
770 aa  863    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0181  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  48.14 
 
 
804 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  70.71 
 
 
778 aa  1168    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  71.35 
 
 
773 aa  1164    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2453  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.87 
 
 
767 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.786176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  47.77 
 
 
759 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  54.62 
 
 
788 aa  878    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  54.62 
 
 
788 aa  878    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0015  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.11 
 
 
787 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  71.77 
 
 
778 aa  1189    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4743  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.7 
 
 
766 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.098191  normal  0.274274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1737  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.27 
 
 
772 aa  751    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.151662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.98 
 
 
774 aa  911    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.12 
 
 
790 aa  883    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  54.62 
 
 
788 aa  878    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.97 
 
 
777 aa  850    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  71.75 
 
 
781 aa  1175    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.62 
 
 
824 aa  881    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  70.57 
 
 
782 aa  1175    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3387  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  74.61 
 
 
774 aa  1216    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0334  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  43.43 
 
 
778 aa  658    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1821  molybdopterin-containing oxidoreductase, formate dehydrogenase  45.1 
 
 
766 aa  672    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.25 
 
 
759 aa  789    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.86 
 
 
774 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.65 
 
 
790 aa  795    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.68 
 
 
772 aa  859    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  47.64 
 
 
759 aa  764    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  56.3 
 
 
765 aa  894    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.32 
 
 
801 aa  877    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.59 
 
 
774 aa  877    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.67 
 
 
797 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0443  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.69 
 
 
774 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.84 
 
 
777 aa  880    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  54.62 
 
 
788 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.61 
 
 
762 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2594  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.54 
 
 
773 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  54.62 
 
 
788 aa  881    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.99 
 
 
759 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1201  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  43.93 
 
 
771 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2958  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.14 
 
 
783 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395597  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  56.24 
 
 
780 aa  860    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.92 
 
 
774 aa  888    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  71.62 
 
 
781 aa  1180    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2122  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  62.06 
 
 
771 aa  996    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.16 
 
 
771 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.07 
 
 
760 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1304  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.72 
 
 
786 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018701  normal  0.917282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0084  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.22 
 
 
764 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.061607  normal  0.113521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0346  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.55 
 
 
771 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0469  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.97 
 
 
766 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171778  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  76.23 
 
 
776 aa  1266    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2691  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.63 
 
 
783 aa  696    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.540438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.11 
 
 
806 aa  891    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.13 
 
 
779 aa  744    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328863  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.45 
 
 
777 aa  890    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2044  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.13 
 
 
762 aa  780    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.631823  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  47.51 
 
 
759 aa  762    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0186  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.93 
 
 
756 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.99 
 
 
759 aa  784    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.86 
 
 
795 aa  886    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0718  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.95 
 
 
774 aa  752    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0704929  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.25 
 
 
759 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2844  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.84 
 
 
769 aa  717    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2637  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.26 
 
 
768 aa  966    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0116295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.86 
 
 
774 aa  886    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0747  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.99 
 
 
781 aa  845    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.59 
 
 
774 aa  877    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.99 
 
 
759 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  70.95 
 
 
773 aa  1157    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0908  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.34 
 
 
765 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3721  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.72 
 
 
787 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.86 
 
 
795 aa  886    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.99 
 
 
759 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3058  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.61 
 
 
769 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731172  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4050  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.42 
 
 
770 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4032  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.72 
 
 
770 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0712  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.08 
 
 
774 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1872  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.79 
 
 
773 aa  845    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.65 
 
 
768 aa  697    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  hitchhiker  0.00785272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1292  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  76.36 
 
 
776 aa  1265    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  56.42 
 
 
770 aa  870    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4009  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.02 
 
 
754 aa  736    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3664  putative oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.53 
 
 
780 aa  708    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123904  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0662  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.93 
 
 
793 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0732  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.95 
 
 
774 aa  752    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0455972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>