More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2844 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  44.58 
 
 
759 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.99 
 
 
763 aa  680    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.58 
 
 
759 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.02 
 
 
776 aa  720    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.03 
 
 
790 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.2 
 
 
781 aa  743    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  50.47 
 
 
781 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  48.75 
 
 
776 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2594  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 
773 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  44.58 
 
 
759 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  50.92 
 
 
764 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  50.98 
 
 
779 aa  744    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0712  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.78 
 
 
774 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  47.59 
 
 
769 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  48.22 
 
 
770 aa  708    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.48 
 
 
774 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.31 
 
 
788 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0181  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  47.66 
 
 
804 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  49.93 
 
 
778 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.31 
 
 
788 aa  717    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0015  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.66 
 
 
787 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.4 
 
 
778 aa  737    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4280  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.39 
 
 
779 aa  741    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1737  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.68 
 
 
772 aa  814    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.151662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.8 
 
 
774 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.81 
 
 
772 aa  691    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  44.71 
 
 
759 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.27 
 
 
777 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.31 
 
 
824 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.27 
 
 
782 aa  735    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3387  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.54 
 
 
774 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.49 
 
 
765 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423554  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.5 
 
 
759 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.29 
 
 
762 aa  675    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.61 
 
 
774 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  44.85 
 
 
759 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.53 
 
 
775 aa  712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2148  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.33 
 
 
761 aa  659    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.963385  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.59 
 
 
801 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.67 
 
 
774 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.15 
 
 
797 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2640  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.93 
 
 
771 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.246289  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2382  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.77 
 
 
763 aa  664    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  44.58 
 
 
759 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5698  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.14 
 
 
785 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00651083 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.18 
 
 
788 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.33 
 
 
770 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.72 
 
 
780 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.37 
 
 
759 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1532  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.8 
 
 
798 aa  680    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.913972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.74 
 
 
765 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12914  formate dehydrogenase H fdhF  50.53 
 
 
779 aa  777    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.812577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.56 
 
 
774 aa  720    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.83 
 
 
779 aa  781    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328863  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2453  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.78 
 
 
767 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.786176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.41 
 
 
771 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.15 
 
 
760 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.88 
 
 
758 aa  713    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.203079  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2057  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.54 
 
 
772 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.06 
 
 
782 aa  731    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.243354  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.5 
 
 
759 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.18 
 
 
788 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.97 
 
 
806 aa  694    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2114  putative oxidoreductase  44.98 
 
 
759 aa  656    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.38 
 
 
777 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.07 
 
 
777 aa  740    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1857  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.01 
 
 
758 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1292  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.75 
 
 
776 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0186  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.86 
 
 
756 aa  667    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.76 
 
 
759 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.04 
 
 
795 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0718  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.31 
 
 
774 aa  800    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0704929  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4743  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.81 
 
 
766 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.098191  normal  0.274274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2844  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  100 
 
 
769 aa  1606    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.46 
 
 
781 aa  744    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02347  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  46.93 
 
 
779 aa  706    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4032  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.47 
 
 
770 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.31 
 
 
788 aa  717    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1763  putative oxidoreductase  44.71 
 
 
759 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0747  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.01 
 
 
781 aa  691    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  50.48 
 
 
773 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.31 
 
 
788 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.67 
 
 
774 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.37 
 
 
759 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  50.48 
 
 
773 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0908  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.49 
 
 
765 aa  835    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3721  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.13 
 
 
787 aa  746    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.04 
 
 
795 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.76 
 
 
759 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.53 
 
 
790 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.73 
 
 
781 aa  749    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1350  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.27 
 
 
755 aa  743    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1872  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.94 
 
 
773 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2122  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.69 
 
 
771 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.6 
 
 
768 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  hitchhiker  0.00785272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2637  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.53 
 
 
768 aa  697    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0116295 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4009  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.96 
 
 
754 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2044  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.56 
 
 
762 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.631823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0662  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.32 
 
 
793 aa  792    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0732  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.31 
 
 
774 aa  800    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0455972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>