More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6418 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  55.19 
 
 
759 aa  852    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.19 
 
 
759 aa  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.93 
 
 
776 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.41 
 
 
765 aa  776    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  55.36 
 
 
759 aa  856    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  50.59 
 
 
781 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.67 
 
 
777 aa  826    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  50.2 
 
 
776 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3058  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.61 
 
 
769 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731172  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  54.11 
 
 
764 aa  824    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  54.38 
 
 
779 aa  833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2637  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.56 
 
 
768 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0116295 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.96 
 
 
788 aa  798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2044  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  68.24 
 
 
762 aa  1054    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.631823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  48.93 
 
 
769 aa  754    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  51.45 
 
 
770 aa  767    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0181  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.06 
 
 
804 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  50.59 
 
 
778 aa  786    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1763  putative oxidoreductase  55.32 
 
 
759 aa  854    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4032  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.74 
 
 
770 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.72 
 
 
781 aa  770    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1292  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.2 
 
 
776 aa  755    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.7 
 
 
788 aa  796    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0015  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 
787 aa  745    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.2 
 
 
778 aa  780    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.65 
 
 
779 aa  658    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328863  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1737  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.16 
 
 
772 aa  664    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.151662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.03 
 
 
774 aa  812    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  55.19 
 
 
759 aa  852    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.33 
 
 
775 aa  750    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.29 
 
 
777 aa  908    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.96 
 
 
824 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.59 
 
 
782 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3387  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.95 
 
 
774 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.7 
 
 
788 aa  796    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1821  molybdopterin-containing oxidoreductase, formate dehydrogenase  49.46 
 
 
766 aa  713    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  97.1 
 
 
759 aa  1539    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2594  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.2 
 
 
773 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.18 
 
 
774 aa  835    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  51.41 
 
 
773 aa  762    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0732  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.4 
 
 
774 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0455972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2122  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.34 
 
 
771 aa  761    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.62 
 
 
772 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.26 
 
 
781 aa  767    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.52 
 
 
801 aa  802    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3744  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.35 
 
 
791 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.11082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.96 
 
 
797 aa  936    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0443  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.8 
 
 
774 aa  689    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0712  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.53 
 
 
774 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.83 
 
 
774 aa  845    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.96 
 
 
788 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  77.87 
 
 
762 aa  1235    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  55.32 
 
 
759 aa  855    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.57 
 
 
788 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  100 
 
 
759 aa  1575    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1201  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49 
 
 
771 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.43 
 
 
763 aa  924    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  94.6 
 
 
790 aa  1497    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.17 
 
 
774 aa  838    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5306  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.8 
 
 
788 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.23 
 
 
771 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  84.72 
 
 
760 aa  1332    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1304  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.08 
 
 
786 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018701  normal  0.917282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0084  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.88 
 
 
764 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.061607  normal  0.113521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0346  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.46 
 
 
771 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0662  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.23 
 
 
793 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2691  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.67 
 
 
783 aa  713    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.540438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.05 
 
 
806 aa  758    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4743  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.38 
 
 
766 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.098191  normal  0.274274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.99 
 
 
777 aa  775    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.56 
 
 
780 aa  813    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  54.97 
 
 
759 aa  850    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0186  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.95 
 
 
756 aa  798    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  96.97 
 
 
759 aa  1537    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.83 
 
 
795 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0718  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.4 
 
 
774 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0704929  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  97.1 
 
 
759 aa  1537    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2844  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.37 
 
 
769 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.05 
 
 
790 aa  834    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.52 
 
 
772 aa  755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.57 
 
 
774 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0747  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.1 
 
 
781 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3664  putative oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.67 
 
 
780 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123904  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.57 
 
 
774 aa  841    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  99.74 
 
 
759 aa  1570    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  51.81 
 
 
773 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0908  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.35 
 
 
765 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0469  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.2 
 
 
766 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171778  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5698  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.73 
 
 
785 aa  887    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00651083 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.83 
 
 
795 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  96.97 
 
 
759 aa  1537    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2958  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.43 
 
 
783 aa  715    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395597  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.99 
 
 
781 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.6 
 
 
770 aa  770    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.7 
 
 
788 aa  796    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2382  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.75 
 
 
763 aa  826    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1872  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.87 
 
 
773 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4774  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.47 
 
 
760 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4050  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.79 
 
 
770 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4009  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.93 
 
 
754 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>