More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0204 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  55.59 
 
 		 759 aa  867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  55.72 
 
 		 759 aa  870    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.59 
 
 		 759 aa  867    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.11 
 
 		 772 aa  771    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  55.59 
 
 		 759 aa  867    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  55.59 
 
 		 759 aa  867    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.48 
 
 		 781 aa  791    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3058  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.25 
 
 		 769 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.28 
 
 		 776 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2637  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 		 768 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0116295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.84 
 
 		 781 aa  781    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  53.15 
 
 		 764 aa  815    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  53.47 
 
 		 779 aa  812    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.46 
 
 		 770 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  51.9 
 
 		 788 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  48.61 
 
 		 769 aa  741    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  51.87 
 
 		 770 aa  768    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0181  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  51.7 
 
 		 804 aa  793    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  51.46 
 
 		 778 aa  782    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.29 
 
 		 788 aa  800    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.95 
 
 		 777 aa  796    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12914  formate dehydrogenase H fdhF  46.73 
 
 		 779 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.812577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0712  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.71 
 
 		 774 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.03 
 
 		 788 aa  797    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0015  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.41 
 
 		 787 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.13 
 
 		 778 aa  783    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4743  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.11 
 
 		 766 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.098191  normal  0.274274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1737  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.03 
 
 		 772 aa  662    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.151662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.9 
 
 		 774 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.07 
 
 		 765 aa  780    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.72 
 
 		 777 aa  946    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2382  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  56.71 
 
 		 763 aa  843    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.29 
 
 		 824 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.45 
 
 		 782 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3387  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.16 
 
 		 774 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.75 
 
 		 776 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1821  molybdopterin-containing oxidoreductase, formate dehydrogenase  46.28 
 
 		 766 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.09 
 
 		 759 aa  941    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1763  putative oxidoreductase  55.72 
 
 		 759 aa  869    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.98 
 
 		 774 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.03 
 
 		 788 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.98 
 
 		 774 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.32 
 
 		 762 aa  947    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.47 
 
 		 801 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4050  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.16 
 
 		 770 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3744  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.75 
 
 		 791 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  100 
 
 		 797 aa  1644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0443  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.47 
 
 		 774 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.59 
 
 		 780 aa  837    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2044  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.66 
 
 		 762 aa  909    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.631823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  55.59 
 
 		 759 aa  866    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2958  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 		 783 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395597  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.96 
 
 		 759 aa  936    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1201  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.35 
 
 		 771 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3664  putative oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.67 
 
 		 780 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.79 
 
 		 774 aa  792    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4032  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.86 
 
 		 770 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.28 
 
 		 775 aa  758    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0469  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.18 
 
 		 766 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.03 
 
 		 771 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.62 
 
 		 760 aa  935    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1304  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.8 
 
 		 786 aa  752    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018701  normal  0.917282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0084  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.56 
 
 		 764 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.061607  normal  0.113521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0346  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.81 
 
 		 771 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.62 
 
 		 790 aa  946    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.03 
 
 		 788 aa  797    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2691  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.54 
 
 		 783 aa  724    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.540438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.68 
 
 		 806 aa  748    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0732  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.58 
 
 		 774 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0455972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53 
 
 		 777 aa  786    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2122  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.48 
 
 		 771 aa  747    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.35 
 
 		 781 aa  786    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0186  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.94 
 
 		 756 aa  770    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1292  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.21 
 
 		 776 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.56 
 
 		 759 aa  932    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.38 
 
 		 795 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0718  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.58 
 
 		 774 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0704929  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.56 
 
 		 759 aa  933    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2844  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.15 
 
 		 769 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.32 
 
 		 763 aa  901    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.4 
 
 		 772 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.71 
 
 		 790 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0747  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.16 
 
 		 781 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0662  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.91 
 
 		 793 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5698  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  58.75 
 
 		 785 aa  910    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00651083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.85 
 
 		 774 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.09 
 
 		 759 aa  937    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  52.27 
 
 		 773 aa  775    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0908  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.81 
 
 		 765 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.58 
 
 		 779 aa  669    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328863  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.38 
 
 		 774 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.38 
 
 		 795 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.56 
 
 		 759 aa  932    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  51.47 
 
 		 773 aa  767    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.57 
 
 		 781 aa  779    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2594  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.81 
 
 		 773 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1872  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.45 
 
 		 773 aa  715    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4774  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.54 
 
 		 760 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  52.29 
 
 		 788 aa  800    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4009  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.59 
 
 		 754 aa  748    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>