More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3058 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  44.44 
 
 
759 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.44 
 
 
759 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.77 
 
 
775 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  44.44 
 
 
759 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  44.84 
 
 
781 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.51 
 
 
774 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  45.63 
 
 
776 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5698  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.02 
 
 
785 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00651083 
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  47.38 
 
 
764 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  47.53 
 
 
779 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  44.58 
 
 
759 aa  656    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  44.09 
 
 
769 aa  673    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  47.52 
 
 
770 aa  666    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2958  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.07 
 
 
783 aa  817    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395597  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0181  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  48.48 
 
 
804 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  44.97 
 
 
778 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3058  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  100 
 
 
769 aa  1592    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731172  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  46.63 
 
 
788 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0015  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.43 
 
 
787 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.84 
 
 
778 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1763  putative oxidoreductase  44.44 
 
 
759 aa  653    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757593  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.73 
 
 
765 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423554  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3664  putative oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.42 
 
 
780 aa  944    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123904  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.89 
 
 
774 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2640  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.41 
 
 
771 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.246289  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4050  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.44 
 
 
770 aa  783    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.4 
 
 
777 aa  745    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2044  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.2 
 
 
762 aa  712    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.631823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.9 
 
 
824 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  43.81 
 
 
782 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3387  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.35 
 
 
774 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1821  molybdopterin-containing oxidoreductase, formate dehydrogenase  88.09 
 
 
766 aa  1416    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.61 
 
 
759 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  44.31 
 
 
759 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.97 
 
 
774 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3140  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.88 
 
 
770 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100079  normal  0.112359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4774  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.78 
 
 
760 aa  817    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1532  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.26 
 
 
798 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.913972  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.73 
 
 
790 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.76 
 
 
801 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2382  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.67 
 
 
763 aa  686    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3744  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.51 
 
 
791 aa  763    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.11082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.25 
 
 
797 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0443  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.93 
 
 
774 aa  942    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.61 
 
 
759 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1201  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.47 
 
 
771 aa  841    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.47 
 
 
759 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.21 
 
 
774 aa  683    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  46.63 
 
 
788 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2381  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.36 
 
 
772 aa  683    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0469  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  88.6 
 
 
766 aa  1420    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171778  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.63 
 
 
776 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.01 
 
 
771 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.18 
 
 
760 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1304  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.75 
 
 
786 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018701  normal  0.917282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0084  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.51 
 
 
764 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.061607  normal  0.113521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0346  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.04 
 
 
771 aa  953    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5306  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.87 
 
 
788 aa  830    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1292  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.71 
 
 
776 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2691  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.14 
 
 
783 aa  722    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.540438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.62 
 
 
806 aa  680    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.09 
 
 
782 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.243354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  44.71 
 
 
759 aa  656    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.34 
 
 
777 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  46.5 
 
 
788 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7586  formate dehydrogenase H alpha subunit  57.85 
 
 
778 aa  918    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  47.18 
 
 
773 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.28 
 
 
759 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.1 
 
 
795 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.02 
 
 
777 aa  675    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4280  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.92 
 
 
779 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.1 
 
 
774 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2417  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.27 
 
 
764 aa  744    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.91 
 
 
780 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.22 
 
 
772 aa  820    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  47.03 
 
 
788 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  46.9 
 
 
788 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2057  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.19 
 
 
772 aa  680    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5246  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.18 
 
 
801 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.99 
 
 
781 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1857  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.6 
 
 
758 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0384  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.48 
 
 
770 aa  958    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.5 
 
 
781 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.64 
 
 
774 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.74 
 
 
759 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.97 
 
 
781 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  47.05 
 
 
773 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02347  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.09 
 
 
779 aa  656    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.84 
 
 
790 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.13 
 
 
770 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  46.63 
 
 
788 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.1 
 
 
795 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.28 
 
 
759 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.01 
 
 
765 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.67 
 
 
763 aa  678    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.36 
 
 
772 aa  683    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6881  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.71 
 
 
778 aa  965    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2114  putative oxidoreductase  44.71 
 
 
759 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.17 
 
 
762 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3184  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.94 
 
 
771 aa  812    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.561879  normal  0.789255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>