More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1201 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  44.83 
 
 		 759 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.98 
 
 		 781 aa  686    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.83 
 
 		 759 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.06 
 
 		 776 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.34 
 
 		 765 aa  734    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.13 
 
 		 775 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  46.51 
 
 		 781 aa  692    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4774  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  63.54 
 
 		 760 aa  1005    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  47.33 
 
 		 776 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2382  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.13 
 
 		 763 aa  754    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  49.01 
 
 		 764 aa  732    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  49.8 
 
 		 779 aa  746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1292  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.4 
 
 		 776 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  44.73 
 
 		 769 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  48.96 
 
 		 788 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  49.26 
 
 		 770 aa  682    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.09 
 
 		 788 aa  739    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0181  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  50.4 
 
 		 804 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  44.82 
 
 		 778 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.09 
 
 		 788 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0015  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.07 
 
 		 787 aa  791    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.22 
 
 		 778 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5698  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.8 
 
 		 785 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00651083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2640  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.16 
 
 		 771 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.246289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.33 
 
 		 762 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.63 
 
 		 774 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.13 
 
 		 777 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2148  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.98 
 
 		 761 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.963385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.8 
 
 		 777 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.35 
 
 		 788 aa  742    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.35 
 
 		 824 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.1 
 
 		 782 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4280  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.21 
 
 		 779 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3387  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.03 
 
 		 774 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1821  molybdopterin-containing oxidoreductase, formate dehydrogenase  55.86 
 
 		 766 aa  844    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.74 
 
 		 759 aa  737    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  47.38 
 
 		 773 aa  678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.73 
 
 		 774 aa  747    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.47 
 
 		 770 aa  700    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2958  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  62.97 
 
 		 783 aa  1006    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395597  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  66.45 
 
 		 772 aa  1052    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.81 
 
 		 801 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  45.09 
 
 		 759 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3744  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.1 
 
 		 791 aa  920    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.35 
 
 		 797 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0443  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.19 
 
 		 774 aa  914    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.93 
 
 		 780 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4009  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.75 
 
 		 754 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3058  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.47 
 
 		 769 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49 
 
 		 759 aa  736    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1201  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  100 
 
 		 771 aa  1598    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.53 
 
 		 790 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.74 
 
 		 772 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.14 
 
 		 774 aa  753    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.38 
 
 		 781 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 		 774 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.4 
 
 		 763 aa  682    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.06 
 
 		 771 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.88 
 
 		 760 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1304  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  62.18 
 
 		 786 aa  993    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018701  normal  0.917282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0084  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  62.8 
 
 		 764 aa  993    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.061607  normal  0.113521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0346  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  59.25 
 
 		 771 aa  916    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  44.83 
 
 		 759 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1532  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.87 
 
 		 798 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.913972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2691  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.6 
 
 		 783 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.540438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.74 
 
 		 806 aa  674    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0469  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.85 
 
 		 766 aa  839    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4743  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.54 
 
 		 766 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.098191  normal  0.274274 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1763  putative oxidoreductase  44.96 
 
 		 759 aa  653    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.95 
 
 		 777 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02347  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  45.73 
 
 		 779 aa  702    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0186  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.96 
 
 		 756 aa  687    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.34 
 
 		 782 aa  688    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.243354  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.27 
 
 		 759 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 		 795 aa  753    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0384  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.77 
 
 		 770 aa  905    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.27 
 
 		 759 aa  742    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1350  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.49 
 
 		 755 aa  692    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3664  putative oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  58.45 
 
 		 780 aa  915    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.4 
 
 		 774 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2044  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.35 
 
 		 762 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.631823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.66 
 
 		 758 aa  695    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.203079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1857  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.47 
 
 		 758 aa  718    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  45.09 
 
 		 759 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.35 
 
 		 788 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.4 
 
 		 774 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.87 
 
 		 759 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  47.38 
 
 		 773 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3140  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  63.97 
 
 		 770 aa  1014    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100079  normal  0.112359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2057  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.01 
 
 		 772 aa  703    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2122  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.69 
 
 		 771 aa  697    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 		 795 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.27 
 
 		 759 aa  745    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  44.83 
 
 		 759 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.51 
 
 		 781 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.4 
 
 		 790 aa  754    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4050  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.55 
 
 		 770 aa  982    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2114  putative oxidoreductase  44.96 
 
 		 759 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  49.09 
 
 		 788 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5306  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  62.5 
 
 		 788 aa  1005    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>