More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4596 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  46.66 
 
 
759 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  73.49 
 
 
781 aa  1204    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.66 
 
 
759 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1292  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  99.36 
 
 
776 aa  1610    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  73.75 
 
 
781 aa  1209    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  100 
 
 
776 aa  1619    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  46.66 
 
 
759 aa  736    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  57.67 
 
 
764 aa  869    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  56.98 
 
 
779 aa  871    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  74.67 
 
 
781 aa  1216    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  97.81 
 
 
776 aa  1592    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  55.25 
 
 
769 aa  872    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  46.53 
 
 
759 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  58.52 
 
 
770 aa  879    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0181  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  47.81 
 
 
804 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  72.7 
 
 
778 aa  1192    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  58.63 
 
 
772 aa  898    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.93 
 
 
790 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.42 
 
 
780 aa  856    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  55.79 
 
 
788 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  55.79 
 
 
788 aa  860    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0015  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.63 
 
 
787 aa  716    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  73.36 
 
 
778 aa  1203    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.87 
 
 
779 aa  715    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328863  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1737  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.92 
 
 
772 aa  745    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.151662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.5 
 
 
774 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.65 
 
 
763 aa  768    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2044  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.58 
 
 
762 aa  780    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.631823  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.19 
 
 
777 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3664  putative oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.42 
 
 
780 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123904  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4050  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.29 
 
 
770 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.79 
 
 
824 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  72.38 
 
 
782 aa  1196    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3387  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  76.61 
 
 
774 aa  1254    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1821  molybdopterin-containing oxidoreductase, formate dehydrogenase  45.9 
 
 
766 aa  673    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.8 
 
 
759 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3058  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.63 
 
 
769 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731172  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.69 
 
 
774 aa  866    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2958  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.45 
 
 
783 aa  708    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395597  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  46.66 
 
 
759 aa  738    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  74.67 
 
 
773 aa  1193    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  73.23 
 
 
781 aa  1206    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.5 
 
 
801 aa  865    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5146  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.35 
 
 
772 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.95 
 
 
774 aa  868    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.28 
 
 
797 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0443  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.08 
 
 
774 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0712  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.88 
 
 
774 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  55.79 
 
 
788 aa  860    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.2 
 
 
759 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1201  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.33 
 
 
771 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4774  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.66 
 
 
760 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2637  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  60.61 
 
 
768 aa  941    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0116295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  54.51 
 
 
774 aa  864    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  55.66 
 
 
788 aa  861    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2382  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.11 
 
 
763 aa  783    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.78 
 
 
771 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.07 
 
 
760 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1304  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.03 
 
 
786 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018701  normal  0.917282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0084  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.84 
 
 
764 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.061607  normal  0.113521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0346  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.21 
 
 
771 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.57 
 
 
765 aa  899    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2691  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.08 
 
 
783 aa  685    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.540438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  58.45 
 
 
806 aa  875    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4743  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.97 
 
 
766 aa  821    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.098191  normal  0.274274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.12 
 
 
777 aa  895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  55.79 
 
 
788 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.99 
 
 
790 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0186  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.68 
 
 
756 aa  731    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  55.79 
 
 
788 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.93 
 
 
759 aa  753    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.72 
 
 
795 aa  871    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0718  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.75 
 
 
774 aa  756    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0704929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.72 
 
 
774 aa  871    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2844  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.75 
 
 
769 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  91.99 
 
 
775 aa  1496    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.8 
 
 
759 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  57.82 
 
 
770 aa  884    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0747  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  52.54 
 
 
781 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0469  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  45.77 
 
 
766 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171778  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.95 
 
 
774 aa  868    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.2 
 
 
759 aa  751    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  74.27 
 
 
773 aa  1185    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0908  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  48.48 
 
 
765 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3721  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  46.28 
 
 
787 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2594  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.33 
 
 
773 aa  740    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  55.72 
 
 
795 aa  871    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.93 
 
 
759 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  49.07 
 
 
762 aa  750    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2453  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.13 
 
 
767 aa  708    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.786176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1872  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  53.77 
 
 
773 aa  830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  47.15 
 
 
768 aa  679    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  hitchhiker  0.00785272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4009  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50 
 
 
754 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  46.79 
 
 
759 aa  740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0662  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.41 
 
 
793 aa  735    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0732  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  51.75 
 
 
774 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0455972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2122  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  61.17 
 
 
771 aa  981    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4032  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  50.59 
 
 
770 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  58.52 
 
 
777 aa  874    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12914  formate dehydrogenase H fdhF  51.45 
 
 
779 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.812577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>