17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2086 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  219  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  56.88 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  57.41 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  55.24 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  48.45 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  46.6 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  40.66 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  43.88 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  39 
 
 		 549 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  42.53 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  40.23 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  36.63 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  25.77 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  32.91 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  34.72 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 100 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>