17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  100 
 
 		 114 aa  226  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  56.88 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  47.52 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  49.46 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  43.75 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  38.64 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  36.36 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  34.41 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  37.37 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  35.92 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  38.38 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  21.21 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  31.19 
 
 		 104 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2985  hypothetical protein  31.33 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000377791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>