17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0468 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  48.52 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  49.5 
 
 		 308 aa  288  9e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  45.18 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  45.79 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  42.21 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  42.37 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1720  HEPN domain protein  32.24 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  32.31 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  31.1 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0174  hypothetical protein  32.9 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582709  normal  0.551801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  29.92 
 
 		 121 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  35 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3627  hypothetical protein  20.4 
 
 		 545 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0267777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  25.64 
 
 		 121 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  29.29 
 
 		 121 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>