22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6110 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  69.15 
 
 		 302 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  58.16 
 
 		 301 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  49.66 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  47.96 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  45.18 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  42.52 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  35.76 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1720  HEPN domain protein  34.45 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0174  hypothetical protein  35.48 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582709  normal  0.551801 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  32.43 
 
 		 110 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 121 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.78 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  28.99 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  28.99 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  31.53 
 
 		 155 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3627  hypothetical protein  21.94 
 
 		 545 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0267777  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  28.04 
 
 		 113 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  36.73 
 
 		 105 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>