24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0463 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 127 aa  263  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  58.06 
 
 		 127 aa  163  9e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  48.36 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1502  DNA polymerase beta subunit  41.05 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000371654 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  33.91 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0587  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.838533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1137  DNA polymerase beta subunit  41.56 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.171922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  76.92 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  62.07 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  59.38 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  53.85 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  31.37 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  51.02 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 130 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  46.77 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  56.76 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  65.38 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  78.26 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>