21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1686 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 121 aa  235  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  41.82 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1392  DNA polymerase beta subunit  44.04 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.206077  normal  0.55899 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  45.78 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  56 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  56.9 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  44.83 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  37.35 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  38.82 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 112 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 128 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0385  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  45.76 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>