18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0855 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 107 aa  216  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1392  DNA polymerase beta subunit  66.67 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.206077  normal  0.55899 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  41.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  47.46 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  37.62 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  43.08 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  41.07 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  35.94 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  45.59 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  46.15 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  36.92 
 
 		 131 aa  40  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  40.51 
 
 		 110 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>