32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4942 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  56.38 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  46.97 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  49.2 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  45.88 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  42.78 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  37.17 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  37.89 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  29.09 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  33.17 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  25.15 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  25.69 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  26.32 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  25.9 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  28.66 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.52 
 
 		 113 aa  44.7  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1687  DNA polymerase beta subunit  24.07 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  30.71 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 107 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 320 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 121 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 98 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 115 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2688  hypothetical protein  26.67 
 
 		 212 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100137  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1550  DNA polymerase beta subunit  28.06 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0936126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>