12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1495 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
218 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4276  DNA polymerase beta domain protein region  43.19 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  42.33 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3118  DNA polymerase beta domain protein region  41.51 
 
 
226 aa  145  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0234  DNA polymerase beta domain protein region  34.16 
 
 
265 aa  121  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.126142  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2550  DNA polymerase beta domain protein region  33.18 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0464694 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  34.92 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  31.5 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0362  DNA polymerase beta subunit  26.36 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  30.4 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  29.73 
 
 
126 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 
206 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>