16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2688 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  42.33 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2550  DNA polymerase beta domain protein region  36.92 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0464694 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0234  DNA polymerase beta domain protein region  37.45 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.126142  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3118  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4276  DNA polymerase beta domain protein region  36.32 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  28.95 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  25.41 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  26.35 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1733  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.65 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  28.33 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>