19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3611 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  47.89 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  47.89 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  40.41 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  39.77 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  35.16 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  36.65 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  32.8 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  40.24 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  40.24 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  40.24 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  35.64 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  32.53 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  31.61 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  26.99 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  28.33 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>