21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1617 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  357  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  63.43 
 
 
176 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  51.98 
 
 
183 aa  192  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  49.11 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  46.15 
 
 
176 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  29.3 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  28.03 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  26.99 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  32.53 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  26.32 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  25.71 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  24.29 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 
196 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 
196 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  29.37 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  27.71 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  26.51 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4012  hypothetical protein  38.96 
 
 
266 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.621097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>