27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0533 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  51.98 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  49.42 
 
 		 191 aa  178  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  49.43 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  45.03 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  27.17 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  27.42 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.39 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  27.22 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  26.24 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  29.34 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  25.19 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  27.92 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  24.71 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  25 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1791  hypothetical protein  30.49 
 
 		 109 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  34.43 
 
 		 119 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 119 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 119 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 130 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>