18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3250 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  55.75 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  49.42 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  49.11 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  49.7 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  28.4 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  28.48 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  24.34 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  27.4 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.17 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  28.4 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  26.32 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  26.32 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  26.32 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  25 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  29 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1791  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>