20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3725 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  46.77 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33760  MarR family regulator  36.09 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  32.45 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  26.32 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  33.15 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  27.17 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  30.57 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  24.12 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  30.86 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  31.87 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  30.53 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  31.02 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  22.88 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  22.29 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  22.67 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>