21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2343 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  47.89 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  39.68 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  40.21 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.36 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  37.1 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  34.54 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  33.16 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  33.16 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  34.05 
 
 		 185 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  29.67 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  31.14 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  31.08 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  27.74 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  25.47 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  26.22 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6014  hypothetical protein  31.62 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  32.06 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>