21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3684 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  55.75 
 
 		 191 aa  208  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  45.03 
 
 		 183 aa  173  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  45.14 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 195 aa  91.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  28.67 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  27.68 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.46 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  28.22 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  26.99 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  25.71 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  25.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  52.5 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  25.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  22.29 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1791  hypothetical protein  30.23 
 
 		 109 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 350 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4012  hypothetical protein  33.77 
 
 		 266 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.621097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>