More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3321 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
350 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  25.8 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  25.22 
 
 
368 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  26.29 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  25.68 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  23.93 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 
105 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
115 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1099  ArsR family transcriptional regulator  21.83 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967799  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  35.62 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
105 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
132 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 
120 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
111 aa  56.2  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  31.96 
 
 
118 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
120 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
125 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
105 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
127 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
119 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  32.58 
 
 
124 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
119 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  32.58 
 
 
124 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
115 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 
116 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 
183 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  31.07 
 
 
125 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  34.33 
 
 
117 aa  53.1  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
126 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
120 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
134 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
107 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 
121 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
312 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  31.91 
 
 
123 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
121 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
120 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  25.84 
 
 
119 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
103 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
330 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  35.14 
 
 
110 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
114 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
124 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  21.04 
 
 
358 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
305 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  42.19 
 
 
135 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 
139 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
125 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
337 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
85 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 
123 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  30 
 
 
119 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 
107 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 
118 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
86 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  33.87 
 
 
120 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
115 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  23.32 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  33.33 
 
 
113 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
93 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
109 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2994  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
98 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
124 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
132 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
120 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 
127 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
131 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
125 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
119 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
98 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  30.99 
 
 
188 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
311 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  26.32 
 
 
135 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
129 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
120 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  33.87 
 
 
102 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
116 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 
89 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
109 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
96 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  34.21 
 
 
119 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 
87 aa  49.3  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>