More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4809 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  75.51 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 		 100 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  75.27 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  65.31 
 
 		 100 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  65.31 
 
 		 100 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  65.31 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  64.29 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  64.89 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  63 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  63.27 
 
 		 100 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.22 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.22 
 
 		 97 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  59.38 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  61.54 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  57.14 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 102 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  49.47 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  52.87 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  46.32 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  52.22 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.86 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  40.22 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 102 aa  50.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 350 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 368 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 368 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  36.84 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  30.39 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  27.88 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>