More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4925 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 106 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  69 
 
 		 100 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  69 
 
 		 100 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  68 
 
 		 100 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  72.16 
 
 		 100 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  66 
 
 		 104 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  66 
 
 		 104 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  68 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  68.37 
 
 		 97 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  67.35 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  65 
 
 		 100 aa  137  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  62.5 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 109 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  63 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 101 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  57.29 
 
 		 102 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  49.5 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  55.81 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  49 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  53.41 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 100 aa  93.2  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.83 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  43.16 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  35.11 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  31.18 
 
 		 266 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  29.55 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 287 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  30.68 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  30.68 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 350 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1556  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>