More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4165 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 115 aa  120  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  47 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  51.65 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 99 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  45.19 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 117 aa  84.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  44.79 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  36.45 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  34.74 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  33.65 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  39.6 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 144 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.05 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  40.38 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  32.04 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  40.66 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.92 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.59 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>