More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5727 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  70.19 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  70.3 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 115 aa  146  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  64.15 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  61.47 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  61.95 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  61.74 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  58.88 
 
 		 110 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  63.73 
 
 		 119 aa  129  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  60.19 
 
 		 113 aa  123  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.36 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 		 140 aa  116  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  60.82 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  52.73 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  53.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  50.96 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  54.37 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  52.53 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 330 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  46.79 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  49.53 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  54.02 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  47 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  47.52 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  45.71 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  50.98 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  47 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 109 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  46.59 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  45.19 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  46.51 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  40.59 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48.89 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  44.71 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>