More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4978 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  276  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  61.48 
 
 
133 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  64.86 
 
 
115 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  63.3 
 
 
112 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  59.09 
 
 
119 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  57.94 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  58.18 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  60.58 
 
 
111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  58.1 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  52.94 
 
 
121 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  57.8 
 
 
118 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  52.59 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  53.27 
 
 
185 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  56.19 
 
 
144 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  56.31 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
114 aa  114  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  50.49 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  52.43 
 
 
112 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  45.93 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
114 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
128 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
115 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  46.94 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  43 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
113 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 
111 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  50.53 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  47.71 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  42.16 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
111 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
120 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  44.23 
 
 
117 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  46.32 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
122 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
118 aa  87  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 
330 aa  86.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  44.9 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  46.24 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  34.58 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48.45 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  39.52 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>