More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0344 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
118 aa  225  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  64.95 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  54.21 
 
 
121 aa  103  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  56.99 
 
 
106 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  52.88 
 
 
141 aa  101  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
129 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.57 
 
 
193 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 
105 aa  94  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  47.9 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  47.42 
 
 
106 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 
126 aa  87  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  55.43 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
140 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  45.63 
 
 
112 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
117 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  46.23 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  47.37 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  45.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  49.45 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  49.45 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.11 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  46.81 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  45.8 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
197 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  49.38 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  47.89 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  35.05 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>