More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1305 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
105 aa  202  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  56.73 
 
 
106 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  54 
 
 
141 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  53.12 
 
 
109 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
193 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
105 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  45.87 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 
118 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 
105 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.62 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  45.56 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  46.58 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  39.18 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  41.3 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  49.32 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
90 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
90 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  53.62 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
111 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
197 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  45.92 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  39.6 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  34.02 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  37.74 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>