More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0477 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  76.61 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  72.57 
 
 
124 aa  130  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 
115 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  63.64 
 
 
120 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  62.75 
 
 
133 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  49.28 
 
 
185 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  61.76 
 
 
111 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
118 aa  119  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  60.19 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  57.28 
 
 
115 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 
111 aa  116  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  53.4 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  57.58 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  53.64 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
124 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
137 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  51.33 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
117 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  56.7 
 
 
144 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 
112 aa  104  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
145 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  51.38 
 
 
112 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  53.27 
 
 
113 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  56.18 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  56.79 
 
 
267 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  55.79 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
110 aa  96.7  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  53.92 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  51.58 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
128 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  41.44 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  41 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
330 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  43.27 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.81 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.51 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  40.2 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31.63 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.67 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  29.59 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  40 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>