More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2163 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  277  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  78.7 
 
 
193 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  79.81 
 
 
129 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  74.07 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  63.89 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  61.29 
 
 
106 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  50.39 
 
 
131 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  57.28 
 
 
130 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 
140 aa  110  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
105 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
117 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  54 
 
 
105 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 
105 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  49 
 
 
109 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  47.27 
 
 
121 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
123 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  48.98 
 
 
105 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  51.58 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  42.45 
 
 
124 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
99 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 
106 aa  87  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
102 aa  77  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  40.59 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.39 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  39.6 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.31 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>