More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3234 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  49.53 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  51.09 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  46.94 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.14 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  34 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.11 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  31.4 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  28.43 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  30.3 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  29.41 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7857  hypothetical protein  41.33 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>