More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1057 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  52.29 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  52.43 
 
 
115 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
121 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  52.43 
 
 
330 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  53.92 
 
 
133 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  53.27 
 
 
121 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
111 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  50.93 
 
 
117 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 
118 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 
120 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
110 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  50.98 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  51 
 
 
118 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  47.32 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  48.18 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  48.54 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
118 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.37 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  52.48 
 
 
119 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  49.51 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  50.5 
 
 
112 aa  94.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  49.5 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
118 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  46.3 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  49.49 
 
 
185 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
115 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 
113 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
123 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
115 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  47.47 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
122 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
120 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  51.04 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
114 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
131 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
112 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  45.95 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  46.53 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 
111 aa  87  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
109 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
120 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
112 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  44.9 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  47.66 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  44.9 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
112 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
115 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  43.88 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>