More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1608 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
131 aa  253  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.67 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  57.52 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  57.94 
 
 
112 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
111 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
141 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  54.05 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  55.46 
 
 
130 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  58.62 
 
 
106 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  51 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  43 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  44 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.16 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  28.7 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  32.69 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.05 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.38 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  42.99 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  31.33 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  30.59 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  26.21 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  28.44 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>