More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0482 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  100 
 
 
108 aa  224  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  85.44 
 
 
104 aa  183  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  85.44 
 
 
104 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  82.52 
 
 
104 aa  173  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  78.7 
 
 
104 aa  173  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  80.2 
 
 
104 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  73.47 
 
 
103 aa  154  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
104 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  56.57 
 
 
103 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
107 aa  97.1  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  42.59 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
107 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  42.57 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  40.57 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
330 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
105 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  49.44 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  45.65 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  34.38 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.19 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
118 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.11 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  37 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.78 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  31.96 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  38.54 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.24 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  34.91 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.85 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>